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幻朧：仙舟を滅ぼす目的で薬王秘伝と協力。薬王秘伝は建木を再生させる手段を求めていたため、星核を何らかの方法で持ち込むことを約束した。直接手を下すより裏から手を回して壊滅させることを好む性格であり、事件の間は停雲の姿で潜伏し、薬王秘伝を実働部隊として利用していた。
羅刹：（幻朧との取引で）星核を届け、羅浮を立ち去ろうとした矢先に埠頭が封鎖される。仕方なく丹恒・素裳と行動を共にすることに。薬師を倒すという共通の目的で鏡流と手を組んでいるが、背景はまだ不明。
鏡流：（幻朧の計画を聞きつけ）薬師を殺すチャンスと見て羅浮に潜入。
薬王秘伝：建木の力を取り戻し仙舟に復讐することを目論む。星核を建木の根に放り込んで活性化させたり、雲騎軍の妨害をおこなったりした。開拓者の潜入捜査で実態が明らかになったが、薬王秘伝のテロ行為を止めるには一歩遅かった。
星核ハンター：星穹列車を仙舟の英雄に仕立て上げるため、わざと捕まる、丹恒の龍尊の力を目覚めさせるなどの工作をした。表向きは事件の犯人とされていた。
景元：星核ハンターは事件の首謀者ではないと推測しており、誘導に従って列車組と協力する傍ら、薬王秘伝や羅刹といった他の容疑者の調査を進めていた。