そもそもecacheを使わなくてもpukiwikiはすべてのページが自動的にキャッシュ生成されます。見るだけならキャッシュから読み込まれるので複雑なページでも重くならないようになってます。ページが書き換えられて再変換が必要なページは自動的にキャッシュが生成されます。メニューは履歴を表示する部分が頻繁に更新されるので再変換が多発すると言うことですね。ecacheで囲まれた部分はそのpukiwiki本来の再変換が無効化されるので、履歴部分まで囲んでしまうと履歴が更新されなくなるということでしょう。
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