自分は基本的に外してますね。仰るように一々誰かから装備を載せ替えるのは面倒ですし、載せっぱにできるほど常に同じ装備構成で使う艦娘が海防艦(稲木改二除く)とAtlanta、遠征組くらいというのが主な理由です。
それと一覧性についてですが、自分は必要以上の装備は持たないようにしています。4%以上の確率で開発できる物は基本廃棄していますし、コモン艦の初期装備や少々のレベリングで入手できる持参装備も廃棄しています。レア艦娘の初期装備を後生大事に抱えている人も見かけますが、その装備を出撃や改修で使う機会がどれほどあるのか?あるいはその将来性は?とよく考え、不要と判断した物は廃棄するのが良いと思います。自分は改で持参する上位装備が改修未実装の主砲の場合は初期装備も取っておくという判断をしています(これによりRichelieu砲の改修が実装された際、改修餌となる初期装備を廃棄していた!という事態は避けられました)。まあこれで一覧性が良くなるかと言われれば微妙ですが、マウスホイールをぐりぐり回して探し回るようなことにはならない程度には改善します。
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