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replaceコマンドは廃止されました。代わりのコントロールパネルの全ページ文字列置換でできます。
実際にコマンド入力するとそのようにメッセージがでます。

全ページ文字列置換

上記機能は同様に検索文字列 / 置換文字列を入力して実行しますが、置換文字列が未入力だと実行できません。よってページ内の既存の文字を綺麗に削除することはできません。
消したい文字列が1行全体ならACB → //ABCみたいにコメントアウトで置換するか、//だけにしてちょっとゴミが残る形にするか。文中の一部を消したいならABC → &null(ABC);など。&null();や&null;でもいいですが。あとで元に戻す可能性を考慮するなら検索可能な文字列を残しておいたほうがよいでしょう。
また試してないですが正規表現は使えないのではないかと思います。

1000ページ程度なら問題ないと思います。仮にもっと多くても、残タスク表示という項目ありタイムアウトせずにやり切ってくれるのではないかと思います。