Switchのソフトのセーブデータは、本体に保存されるはずです。ただ、いっせいトライアル後(DL版)にパッケージ版を導入しているのが、もしかしたら影響しているかも…いえ、断言はできませんが。DL版のソフトデータの方のみを一旦消す(セーブデータは残る)、電源ボタン長押しのメニューから本体の電源をOFFにしゲームカードとSDカードを挿し直す等も、試してください。
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Switchのソフトのセーブデータは、本体に保存されるはずです。ただ、いっせいトライアル後(DL版)にパッケージ版を導入しているのが、もしかしたら影響しているかも…いえ、断言はできませんが。DL版のソフトデータの方のみを一旦消す(セーブデータは残る)、電源ボタン長押しのメニューから本体の電源をOFFにしゲームカードとSDカードを挿し直す等も、試してください。