他の方々が疑問として提示されている内容や、アドバイスの内容と、それに対するタークンさんのコメントがかなり食い違っている感があります。
再度何に対してアドバイスされているのかをしっかり理解してみてください。
Excelでのファイルの出力方法は、「メニューのファイルから保存」するだけではありません。例えばExcelでVBAを使用することでCSVを出力できますが、これも試されましたか?
他、「届書作成プログラム」で出力したファイルに上書きする方法ではどうでしょうか?
Excelから出力したCSVファイルの16進コードや文字コードが「届書作成プログラム」で出力したファイルと比較して変わっていないかなどを確認するのも良いかもしれません。
※ちなみに「EXCELL」ではなく「Excel」です(「l」が多い)
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