メギド72 攻略wiki

「アプリをインストールしてデータ一括ダウンロードをしておけば、端末に保存されたデータでストーリーを追ったりガチャを引いたりできる」
この認識で大丈夫です。
3月9日までに一括DLを済ませておくと、バトルやガチャ（キャラの獲得）、キャラの育成やアイテムの作成などがオンライン版と同様に楽しむ事ができます。

「プロデューサーレター 番外編」「プロデューサーレター 番外編２」にてその部分の回答がされており
・一括DLしていない状態でもメインシナリオを読む＆BGMを聞く事はできる
・一括DLしていない状態だと（ゲームを遊ぶためのキャラ・敵・アイテム・マップデータなどがスマホ内にDLされていないため）その他の機能は遊べないので、事前にDLを済ませておく必要がある

よって、上記2つの記事の内容からの推測になりますが
・一括DLが済んだ状態だと、現時点で未開放のキャラ、メイン・イベントクエストのマップ、星間の禁域などもオフライン版で開放可能、バトルも楽しむ事ができる
なのだと思います。

一括DLはアジト（いわゆる機能一覧）のオプション画面から行う必要があり、アジトが開放されるのが「メイン2-1クリア」なので、事前にそこまでプレイしておく必要があることにご注意ください。
（概ね30分程度でアクセスできますが、DLデータが７GBと重いので、時間に余裕をもって行ってください）