(私はiPhoneは使っていないので検証できないですが)HELPから「Appleでサインイン」の項目と「ゲーム「ミステリー探偵ジューン」のバックアップ」の項目を参照してください。
同じ Apple ID を使っている場合(iOS13以上のとき)、右上の設定(歯車マーク)からソーシャルをクリックするだけで セーブデータの同期が行われるので注意しないと片方のセーブデータで上書きされてしまいます。
iPhoneのバックアップと復元は おそらく手動だと思いますが、自動で行う設定にしている場合は注意が必要です。
別々の Apple ID を使っている場合は 大丈夫です。
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