色廃集会所

検索した情報の共有とそれに基づいて回答をさせていただきます。
「どちらの姿になるかは暗号化定数で決まるようで、みつふしになる確率はかなり低めの1%(暗号化定数または旧性格値を100で割った余りが0)」[引用:ネタポケまとめ改@wiki→ノココッチ※イッカネズミにも同様の記載あり]
また海外の解析勢がみつふし・3匹家族について進化の際の確率が1/100であり、暗号化定数に基づいて決定される旨のツイートをしています。[元ツイはEncryption Dudunsparceで検索]

例に挙げられた「過去作の孵化親IDが変わったことによる色違い判定」については、ザックリ①孵化させるロムの親IDと②タマゴの性格値≒現暗号化定数(全世代で遅くてもタマゴを受け取った時点で固定済)が孵化するタイミングで突合されることにより生じています。通常の孵化厳選では①の条件で色違いになる②を厳選するのに対し、マナフィを代表とするロムリセットでは②の条件で色違いになる①を厳選します。(タマゴの正確な仕様についてはだいたいマナフィ厳選や固定孵化等の解説に記載されていますのでそちらを参照ください。)

上の情報が正しければノココッチ・イッカネズミのフォルム進化に関して、個体依存の数値(暗号化定数)のみの判定であり親IDが関わる判定ではないので、仮にリセットでタマゴの状態に戻して他ROMへ輸送して進化させてもロムによって別のフォルムになることはない、という解釈になります。
従ってどのような状況であれロムAでみつふし・3匹家族にならなければロムBやCに送って進化させてもみつふし・3匹家族にはならない、というのが検索結果を元にした回答となります。参考になりましたら幸いです。

ありがとうございます
大変参考になりました
修羅の道に抜け道はなかった…